91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0708 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0708  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2753  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.03 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.840524  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  29.89 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.13 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.2 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.09 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  32.63 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.68 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  27.22 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  27.23 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.14 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.76 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.54 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  25.13 
 
 		 456 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  25.49 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.51 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  25.64 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  24.37 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.65 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.14 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  31.43 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  31.43 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.14 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  31.43 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.47 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.43 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  25.13 
 
 		 459 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.89 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.13 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  27.54 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  24.1 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.27 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.4 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  30.29 
 
 		 331 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.1 
 
 		 301 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  29.05 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  24.74 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.19 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  30.29 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 		 299 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.29 
 
 		 330 aa  45.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  30.29 
 
 		 336 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  24.7 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.65 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.48 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  24.59 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  35.09 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  30.68 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  26.53 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  26.53 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.08 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  30.29 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  26.67 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.13 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.21 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  27.01 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  25.63 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.56 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  28.38 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  24.84 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  21.99 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  24.53 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  24.79 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.38 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  25.68 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  25.61 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.4 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.18 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 		 458 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  36.9 
 
 		 355 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.4 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  23.08 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  23.08 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  27.11 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.44 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  23.53 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  24.61 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  25.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  26.03 
 
 		 302 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  24.18 
 
 		 301 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>