More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0464 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0464  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
631 aa  1220    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
658 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
632 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
651 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
651 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
651 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5141  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
638 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 
1101 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
1120 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.64 
 
 
1099 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 
1154 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28 
 
 
403 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.8 
 
 
461 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
1002 aa  106  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
1118 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 
1124 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.11 
 
 
411 aa  99  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
752 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
479 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
479 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
479 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
425 aa  91.3  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
441 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.96 
 
 
422 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  30.32 
 
 
433 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  30.32 
 
 
433 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  30.32 
 
 
433 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  26.33 
 
 
437 aa  87.8  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  29.37 
 
 
433 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
549 aa  87.4  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
512 aa  87  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.08 
 
 
927 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.41 
 
 
1115 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.52 
 
 
1115 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  29.37 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  29.6 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.1 
 
 
872 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.88 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.08 
 
 
1115 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.52 
 
 
1119 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  27.02 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.52 
 
 
1115 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  27.24 
 
 
694 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
362 aa  83.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
789 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
789 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
789 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
1184 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
450 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  26.87 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  26.87 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  26.87 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  26.87 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  26.87 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  26.87 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  29.53 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  23.43 
 
 
464 aa  77  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  25.58 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  25.7 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
378 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
429 aa  73.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
903 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  20.36 
 
 
412 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.78 
 
 
425 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
433 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.78 
 
 
425 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  23.53 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.49 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  23.53 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.49 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.49 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.33 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30.33 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  25.19 
 
 
716 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>