More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0574 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0574  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  67.37 
 
 		 250 aa  338  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  38.46 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.6 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  37.56 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  41.75 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  40 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.77 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  37.07 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  39.01 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  37.56 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  37.56 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  36.17 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  41.58 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  39.9 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  38.42 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.6 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  35.34 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  39.36 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.36 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.36 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  39.36 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  34.89 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  39.89 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.74 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  37.77 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  40.11 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  40.11 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  40.11 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3447  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  29.31 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  29.46 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  29.46 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1939  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  34.39 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2066  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  35.03 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.751353  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  31.45 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  29.46 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  27.6 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  31.85 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  25.11 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.74 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  27.03 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  25.11 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.11 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  25.13 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  25.68 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.14 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.14 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  26.79 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.36 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  29.6 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  27.03 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  24.66 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  28.28 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  28.18 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.15 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  26.11 
 
 		 652 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4096  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 184 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  26.77 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.25 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2013  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.19 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.44 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  26.7 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.72 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.72 
 
 		 224 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  26.77 
 
 		 225 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  27.15 
 
 		 223 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  27.72 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  25.33 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.18 
 
 		 224 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  30.06 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  28.43 
 
 		 220 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1608  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.82 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>