More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4537 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 147 aa  289  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  35.04 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  32.06 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  33.61 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  30.23 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  39.39 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  34.72 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  33.7 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 151 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 151 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  36.56 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  27.68 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  29.63 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  34.88 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  31.18 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  32.35 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>