More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3114 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  100 
 
 
446 aa  891    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  31.78 
 
 
464 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  30.67 
 
 
470 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11160  predicted protein  29.22 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.882711  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9233  predicted protein  28.29 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000123745  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 
439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  28.36 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
716 aa  111  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 
786 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 
429 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  26.24 
 
 
387 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  27.49 
 
 
421 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  28.78 
 
 
467 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 
437 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.27 
 
 
437 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.27 
 
 
438 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.27 
 
 
437 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.27 
 
 
438 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.27 
 
 
438 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  27.17 
 
 
477 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.27 
 
 
438 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.27 
 
 
438 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  27.07 
 
 
470 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.27 
 
 
438 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  29.02 
 
 
457 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  31.36 
 
 
451 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  23.89 
 
 
426 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  25.98 
 
 
441 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 
466 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 
770 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.5 
 
 
440 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  30.63 
 
 
451 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  27.78 
 
 
473 aa  99.8  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.45 
 
 
456 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 
506 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  26.53 
 
 
467 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.03 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.14 
 
 
443 aa  99.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  27.05 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  27.09 
 
 
467 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 
515 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  27.27 
 
 
482 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  26.88 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 
521 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 
463 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 
441 aa  97.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 
427 aa  97.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 
773 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 
503 aa  97.1  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  30.34 
 
 
433 aa  97.1  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  27 
 
 
470 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  27.12 
 
 
470 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  27.12 
 
 
470 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 
641 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  28.28 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  25.84 
 
 
467 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  27.25 
 
 
469 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  26.54 
 
 
470 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  27.54 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  27.54 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  27.54 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  27.54 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 
494 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  27.54 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 
518 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  27.55 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  26.72 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  27.54 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 
453 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  31.83 
 
 
439 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  24.94 
 
 
486 aa  94  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 
500 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.56 
 
 
483 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  26.61 
 
 
482 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  26.61 
 
 
482 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.87 
 
 
486 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.87 
 
 
486 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 
443 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  26.65 
 
 
455 aa  93.6  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 
520 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  26.96 
 
 
467 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  30.88 
 
 
460 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  25.79 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  26.89 
 
 
482 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 
491 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 
496 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 
455 aa  92.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  26.96 
 
 
467 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.71 
 
 
460 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  27.25 
 
 
469 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 
462 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  26.93 
 
 
467 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  27.99 
 
 
458 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 
503 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
457 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>