174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2784 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  100 
 
 
84 aa  179  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  43.08 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  38.27 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  37.18 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  47.27 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  37.7 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  45.45 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  44.44 
 
 
391 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  32.5 
 
 
384 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  37.68 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  37.93 
 
 
398 aa  51.6  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.93 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  42.62 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  40.68 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  31.15 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  40.3 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  33.75 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  32.14 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  31.15 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  32.1 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  36.07 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  36.36 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  36.36 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  32.05 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  30.88 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  37.7 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  42.62 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  33.93 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  31.67 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  31.67 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  31.67 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  31.82 
 
 
116 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  43.4 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.84 
 
 
72 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  32.79 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  31.17 
 
 
383 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  35.09 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  32.79 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  30.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.49 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  32.26 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  36.71 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  40.98 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  28.12 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  29.85 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  34.55 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  38.98 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  30.16 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  31.15 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  39.29 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  30.65 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  32.14 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  26.83 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  38.33 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  27.71 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  40 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  33.85 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  33.85 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  40.38 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  32.14 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  35.29 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  33.87 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.55 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  31.71 
 
 
402 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  27.71 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  28.79 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  30.16 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  35.94 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  32.79 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  26.51 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  40 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  27.69 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  38.98 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  32.14 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  36.84 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  30.77 
 
 
86 aa  43.9  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  32.73 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  24.59 
 
 
78 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>