More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1534 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 453 aa  925    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  53.88 
 
 		 448 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  51.28 
 
 		 438 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  48.97 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  48.97 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  48.74 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  48.74 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  51.77 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  48.51 
 
 		 468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  48.51 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  48.74 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  47.82 
 
 		 454 aa  441  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  47.82 
 
 		 479 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  47.59 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  52.16 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  47.36 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  50.46 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  49.65 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  49.77 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  48.84 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  49.77 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  47.79 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  49.08 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  50.69 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  49.76 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  48.95 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  48.29 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  48.86 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  48.55 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  47.67 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  47.8 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  48.64 
 
 		 450 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  47.89 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  48.17 
 
 		 429 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  48.53 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  50.58 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  49.76 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  48.03 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  49.09 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  49.05 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  47.56 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  47.8 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  47.67 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  50.34 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  47.8 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  48.37 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  49.88 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  47.33 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  46.84 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  49.54 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  49.66 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  51.04 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  48.09 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  50.35 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  48.46 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  45.73 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  49.41 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.85 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  47.38 
 
 		 450 aa  388  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  49.09 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  46.35 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  48.6 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  47.93 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  45.5 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  45.2 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  45.67 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  46.81 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  45.73 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  45.73 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  45.65 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  45.61 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  45.61 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  46.01 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  45.61 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  45.61 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  45.65 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  49.55 
 
 		 489 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  45.75 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  45.75 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  49.55 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  45.41 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  45.75 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  47.5 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  49.41 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  47.33 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  45.75 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  45.75 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  47.9 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  45.52 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  49.89 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  45.75 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>