More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0880 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  100 
 
 		 629 aa  1280    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00197  amidohydrolase family protein  34.08 
 
 		 415 aa  193  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  38.78 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  27.38 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 341 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  32.43 
 
 		 246 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 341 aa  69.7  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  26.65 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  25.78 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  28.85 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 317 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  32.41 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 		 341 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  35.4 
 
 		 242 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 267 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1352  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 		 233 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.71 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  23.7 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 239 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  26.41 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  24.74 
 
 		 414 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.19 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.19 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.06 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  24.18 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  36.36 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 349 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  27.78 
 
 		 292 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  31.75 
 
 		 259 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 265 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.63 
 
 		 242 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  29.05 
 
 		 256 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 259 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 207 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  26.49 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 257 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.06 
 
 		 287 aa  59.7  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.08 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.85 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5074  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  27.97 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  32.47 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0256  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.68 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.757701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.47 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.4 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.61 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  31.72 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 327 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 244 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 173 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  27.66 
 
 		 262 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 348 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 		 235 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  31.06 
 
 		 290 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 303 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.75 
 
 		 243 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  34.71 
 
 		 324 aa  57  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>