More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1139 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 468 aa  933    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 470 aa  786    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  63.03 
 
 		 470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.4 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.5 
 
 		 482 aa  289  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  43.11 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  41.4 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.67 
 
 		 483 aa  276  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 422 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.58 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.78 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 477 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 477 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 554 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  29.98 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.98 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 477 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.32 
 
 		 470 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 547 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 498 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  29.42 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2275  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.73 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.95 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0258  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  23.23 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.79 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.74 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 501 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  30.47 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 479 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3062  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 474 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  23.45 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  22.79 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.37 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.48 
 
 		 483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  29.25 
 
 		 493 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.15 
 
 		 472 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262075  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.57 
 
 		 471 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  28.01 
 
 		 470 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  25.78 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  28.01 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.79 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.97 
 
 		 472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  23.45 
 
 		 503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.97 
 
 		 472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  22.35 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  25.94 
 
 		 477 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0968  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 497 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.842177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 483 aa  136  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.97 
 
 		 495 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3084  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.189557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4836  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 459 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  28.54 
 
 		 475 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.07 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>