More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0518 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  70.09 
 
 		 221 aa  304  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  71.3 
 
 		 214 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  71.64 
 
 		 213 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.38 
 
 		 219 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.5 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  72.6 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.91 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  67.62 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.55 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.71 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.71 
 
 		 233 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.45 
 
 		 218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  65.53 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  64.32 
 
 		 216 aa  267  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  65.53 
 
 		 212 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  66.99 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  64.56 
 
 		 212 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  64.42 
 
 		 213 aa  264  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.9 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  64.45 
 
 		 216 aa  261  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  64.59 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  62.2 
 
 		 218 aa  258  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  60.73 
 
 		 217 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  61.95 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.53 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 216 aa  252  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.42 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.09 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  60.66 
 
 		 214 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.26 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  62.67 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.56 
 
 		 223 aa  235  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 207 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.79 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.26 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.26 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  43.54 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  39.05 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.89 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  43.3 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  44.75 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.23 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>