More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0413 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
355 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  74.86 
 
 
356 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  75.14 
 
 
358 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  68.36 
 
 
355 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  67.71 
 
 
355 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  63.84 
 
 
355 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  60.73 
 
 
355 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  61.58 
 
 
355 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  60.73 
 
 
355 aa  431  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.18 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.34 
 
 
358 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
357 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.42 
 
 
354 aa  355  5e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 
357 aa  352  7e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.27 
 
 
355 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.56 
 
 
357 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.75 
 
 
357 aa  348  8e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  49.44 
 
 
358 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 
357 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.75 
 
 
376 aa  344  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.53 
 
 
364 aa  338  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.56 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.45 
 
 
355 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.03 
 
 
357 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.74 
 
 
355 aa  330  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.74 
 
 
355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.18 
 
 
355 aa  325  7e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.89 
 
 
353 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.34 
 
 
357 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.13 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 
354 aa  309  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.57 
 
 
358 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.32 
 
 
344 aa  294  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.1 
 
 
355 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.3 
 
 
354 aa  277  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.31 
 
 
351 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.75 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.59 
 
 
320 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.41 
 
 
397 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  32.68 
 
 
365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
411 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  34.01 
 
 
411 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  33.82 
 
 
400 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.19 
 
 
400 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.56 
 
 
414 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
294 aa  176  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.43 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2411  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.7 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.5 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.02 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 
399 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.82 
 
 
400 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  32.65 
 
 
411 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.43 
 
 
292 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.6 
 
 
289 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.32 
 
 
291 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1894  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.66 
 
 
292 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284713  normal  0.0266706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.8 
 
 
305 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1007  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.69 
 
 
300 aa  169  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.96 
 
 
291 aa  169  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000315653  normal  0.563962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1919  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
298 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.59 
 
 
292 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.18 
 
 
307 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.36 
 
 
298 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.18 
 
 
240 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.32 
 
 
295 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.32 
 
 
294 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.6 
 
 
292 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0479  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
293 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.778561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.37 
 
 
293 aa  166  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.51 
 
 
294 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.65 
 
 
292 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.51 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.02 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  38.56 
 
 
235 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.84 
 
 
245 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  35.95 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.1 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.04 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0416  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  37.14 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.06 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
296 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.1 
 
 
294 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.88 
 
 
296 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.5 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09040  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.9 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00724889  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.05 
 
 
245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1570  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.89 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1914  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.14 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>