42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1443 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  672    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  34.23 
 
 
337 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  29.94 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  33.43 
 
 
347 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  32.93 
 
 
342 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  31.04 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  29.59 
 
 
347 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  29.18 
 
 
352 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  24.71 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  30.25 
 
 
344 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  29.88 
 
 
347 aa  132  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  28.26 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  32.18 
 
 
342 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  30.81 
 
 
352 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  26.3 
 
 
340 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  27.05 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  25.27 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  25.27 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  22.7 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  22.7 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.67 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  22.3 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  27.11 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  25.68 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  23.96 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  26.19 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  25.61 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  22.85 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  25.09 
 
 
360 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  27.13 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  22.29 
 
 
360 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  23.66 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  22.55 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  22.98 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  23.36 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.64 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  23.26 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  26 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  21.77 
 
 
385 aa  46.2  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  24.92 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  23.66 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  28.46 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>