39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0434 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  35.41 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  35.57 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  34.3 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  36.34 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  32.07 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  34.3 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  32.02 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  28.74 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  27.78 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  26.55 
 
 		 347 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  25.07 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  28.32 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.53 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.67 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.3 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  22.22 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  22.9 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  23.51 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.82 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  29.01 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  29.39 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  26.14 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  23.64 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  23.86 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  26.25 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  26.29 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  26.29 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  31.21 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  20.92 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.77 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  19.92 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  23.37 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  23.88 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  22.32 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  22.77 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  21.69 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  29.5 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>