More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0338 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  100 
 
 
347 aa  711    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  64.55 
 
 
350 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  63.4 
 
 
350 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  62.57 
 
 
348 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  62.82 
 
 
350 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  62.03 
 
 
349 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  60.58 
 
 
349 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  64.12 
 
 
345 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  59.42 
 
 
347 aa  418  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  60.86 
 
 
350 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  60.12 
 
 
349 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  52.77 
 
 
350 aa  375  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  57.68 
 
 
349 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  53.06 
 
 
350 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  57.68 
 
 
349 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  57.39 
 
 
349 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  54.81 
 
 
349 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  53.91 
 
 
349 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  52.74 
 
 
346 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  51.02 
 
 
349 aa  354  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  50.87 
 
 
348 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  50.44 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  50.43 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.13 
 
 
350 aa  320  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  47.04 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  49.86 
 
 
348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  27.75 
 
 
481 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  27.37 
 
 
490 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26 
 
 
502 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.12 
 
 
913 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  26.38 
 
 
485 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  25.07 
 
 
495 aa  85.9  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.64 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.44 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.46 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  30.38 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.82 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  24.35 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.06 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.06 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.21 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.32 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.68 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.15 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0666  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.31 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.52577  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.33 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.24 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.57 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  25.65 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  26.18 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  23.59 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2502  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.2 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0775365 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.85 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.61 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.32 
 
 
412 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  25.07 
 
 
390 aa  67  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.32 
 
 
412 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.04 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.1 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.77 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.62 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0682  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.18 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0646  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.88 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.44 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.96 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2221  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.47 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.00000055918  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  21.52 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2560  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.86 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0016  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.29 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.14 
 
 
464 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  25.48 
 
 
474 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25 
 
 
319 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0023  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.9 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.96 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0133  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.58 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00186907  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1664  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.64 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  22.87 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.68 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0165  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.93 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.367012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01087  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  23.3 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000578388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2510  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.3 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000101658  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.3 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.16382e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01095  hypothetical protein  23.3 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000485703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.77 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3108  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.08 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0448  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.3 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0914  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  22.19 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.72 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.35 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.467035  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.54 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>