211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4059 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4059  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 
333 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332012  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5918  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  75.08 
 
 
400 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0598  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  80.78 
 
 
332 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0619  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  80.48 
 
 
332 aa  474  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.109735  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  55.59 
 
 
273 aa  328  7e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  73.1 
 
 
332 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  75.17 
 
 
251 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  67.31 
 
 
263 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  74 
 
 
358 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.2 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  48.84 
 
 
273 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  54.42 
 
 
260 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  42.11 
 
 
252 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  43.05 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  43.05 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  52.41 
 
 
267 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  51.03 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  47.25 
 
 
246 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  49.66 
 
 
248 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  44.52 
 
 
268 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  40.19 
 
 
248 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1137  hemolysin A  52 
 
 
252 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  51.39 
 
 
252 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  42.78 
 
 
242 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  44.51 
 
 
249 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1226  hemolysin A  50.99 
 
 
249 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  43 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  49.31 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  49.31 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  46.98 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  46.98 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  44.97 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  49.32 
 
 
246 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  44.23 
 
 
253 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1158  hemolysin A  50 
 
 
240 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  47.97 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  47.62 
 
 
252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  43.78 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  46.75 
 
 
248 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  52.03 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2767  hemolysin A  37.29 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000408099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  50 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  40.94 
 
 
266 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  50.35 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  47.74 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  45.7 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  47.59 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15831  rRNA methyltransferase  46.21 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  48.65 
 
 
249 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0632  hemolysin A  47.95 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0985618  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  47.62 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  39.58 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  43.71 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  42.47 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  48.63 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  48.99 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  45.26 
 
 
246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  45.88 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  48.03 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  48.61 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  44.83 
 
 
274 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  42.16 
 
 
253 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  42.53 
 
 
258 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  45.26 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  45.14 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  45.39 
 
 
260 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  45.14 
 
 
264 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  44.44 
 
 
272 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1045  hemolysin A  40.94 
 
 
271 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.323407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  46.43 
 
 
247 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  46.53 
 
 
272 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  42 
 
 
270 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  46.88 
 
 
272 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  47.22 
 
 
268 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  44.22 
 
 
251 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  36.96 
 
 
284 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  47.62 
 
 
252 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  46.1 
 
 
251 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  40.69 
 
 
248 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  46.05 
 
 
257 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  44.44 
 
 
267 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  46.05 
 
 
257 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  46.21 
 
 
253 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  37.36 
 
 
268 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  46.62 
 
 
279 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  41.72 
 
 
277 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  46.26 
 
 
270 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  40.11 
 
 
279 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  43.6 
 
 
267 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  40.11 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  40.11 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  40.11 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  49.31 
 
 
281 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  40.11 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  43.75 
 
 
269 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  48.57 
 
 
246 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  44.44 
 
 
270 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  47.48 
 
 
253 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  40.11 
 
 
279 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  45.39 
 
 
252 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>