More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0185 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  68.16 
 
 
184 aa  276  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  68.72 
 
 
184 aa  270  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1627  ribosomal protein L5  69.1 
 
 
191 aa  266  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
184 aa  263  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 
183 aa  244  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.5 
 
 
191 aa  244  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0614  ribosomal protein L5  63.13 
 
 
188 aa  243  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
179 aa  241  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  62.15 
 
 
183 aa  239  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1926  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 
186 aa  238  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  235  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.78 
 
 
180 aa  234  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
183 aa  233  9e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.67 
 
 
183 aa  231  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
182 aa  230  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 
179 aa  230  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  229  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
180 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  228  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
179 aa  228  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  228  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 
179 aa  227  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  226  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  225  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  224  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  224  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
195 aa  224  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  224  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
180 aa  223  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  223  9e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
178 aa  223  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
181 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
178 aa  223  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  57.22 
 
 
223 aa  223  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
184 aa  222  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  222  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
180 aa  222  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  222  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  222  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  222  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  222  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
180 aa  221  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
196 aa  221  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  222  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  221  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  56.5 
 
 
180 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
193 aa  221  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  221  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  221  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>