80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0968 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0968  small GTP-binding protein  100 
 
 
501 aa  1001    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  29.58 
 
 
1228 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  28.57 
 
 
1249 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  25.65 
 
 
1219 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  24.61 
 
 
1219 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.22 
 
 
1219 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.11 
 
 
1219 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.51 
 
 
1219 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.51 
 
 
1219 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.73 
 
 
1219 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.24 
 
 
1219 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.51 
 
 
1219 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  25.33 
 
 
1219 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.24 
 
 
1219 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  24.74 
 
 
1145 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  23.58 
 
 
1146 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  23.58 
 
 
1146 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.45 
 
 
546 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  25 
 
 
523 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.06 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.18 
 
 
548 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  27.52 
 
 
1415 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  22.63 
 
 
581 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  32.82 
 
 
303 aa  53.5  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.67 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.36 
 
 
431 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  24.37 
 
 
460 aa  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  29.71 
 
 
463 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3276  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.98 
 
 
200 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  32.34 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  24.26 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  33.61 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  33.61 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  29.09 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 
304 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.81 
 
 
583 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 
304 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  29.91 
 
 
459 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  26.53 
 
 
477 aa  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  28.8 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  30 
 
 
566 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.3 
 
 
637 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.32 
 
 
632 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
713 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  31.36 
 
 
520 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0284  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.34 
 
 
224 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1624  GTP-binding protein EngA  25.19 
 
 
437 aa  47  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.565401  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  37.29 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.56 
 
 
585 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  34.15 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  34 
 
 
648 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  23.78 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  34.06 
 
 
462 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  23.73 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 
307 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  25.16 
 
 
398 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  29.25 
 
 
475 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  32.61 
 
 
462 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  33.08 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2275  small GTP-binding protein  26.94 
 
 
244 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  33.9 
 
 
448 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  28.46 
 
 
438 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  28.46 
 
 
438 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  32.04 
 
 
728 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  40 
 
 
549 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_359  predicted protein  34.18 
 
 
646 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  22.07 
 
 
461 aa  44.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  32.54 
 
 
454 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  32.77 
 
 
445 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  24.29 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.56 
 
 
542 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.32 
 
 
585 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  26.69 
 
 
537 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0953  ribosome-associated GTPase EngA  31.97 
 
 
437 aa  43.9  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  31.21 
 
 
461 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  30.22 
 
 
479 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  29.71 
 
 
511 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  30.22 
 
 
479 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  31.19 
 
 
436 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  24.06 
 
 
589 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>