More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0947 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0947  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  27.95 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1516  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2442  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0425  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1421  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.08 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  27.82 
 
 		 292 aa  92  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0657  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0325779  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  25.3 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  23.39 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 314 aa  89  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  23.23 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1584  transcriptional regulator, LysR family protein  26.74 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  28.84 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  27.05 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  26.87 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1508  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000734154  hitchhiker  0.000350474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.66 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1279  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0337  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0334498  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5316  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.680979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4621  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0988877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1102  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  25.83 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  0.0000000664485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4355  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>