More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05188 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  100 
 
 
463 aa  951    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  36.33 
 
 
321 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84962  predicted protein  39.63 
 
 
289 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.536372  normal  0.854998 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  38.85 
 
 
158 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  28.03 
 
 
245 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4263  ribonuclease H  40.13 
 
 
162 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000698062  hitchhiker  0.0000000000000553912 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0297  ribonuclease HI  36.84 
 
 
361 aa  94.7  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1751  ribonuclease HI  46 
 
 
278 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  26.01 
 
 
241 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  38.62 
 
 
157 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  41.03 
 
 
151 aa  90.5  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1743  ribonuclease H  44.55 
 
 
175 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  36.42 
 
 
149 aa  89.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  38.26 
 
 
159 aa  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  39.6 
 
 
175 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  44.66 
 
 
235 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  40 
 
 
155 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0160  ribonuclease H  40.14 
 
 
191 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  40.28 
 
 
185 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  36.67 
 
 
148 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  40.14 
 
 
148 aa  88.6  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  39.58 
 
 
155 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  37.25 
 
 
156 aa  88.2  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  33.54 
 
 
160 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  34.84 
 
 
161 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  34.27 
 
 
170 aa  87.8  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  43.69 
 
 
151 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  38.93 
 
 
151 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  34.23 
 
 
175 aa  86.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  39.31 
 
 
154 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  36.18 
 
 
148 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  34.46 
 
 
157 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  36.36 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  43.69 
 
 
150 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  43.69 
 
 
141 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  37.41 
 
 
153 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  37.27 
 
 
159 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  31.45 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  43.69 
 
 
150 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  36.73 
 
 
160 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  40 
 
 
160 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  37.5 
 
 
145 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  34.18 
 
 
154 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  37.41 
 
 
154 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  34.69 
 
 
143 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  35.44 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  38.93 
 
 
157 aa  84  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  36.18 
 
 
155 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  36.08 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  37.84 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  38.89 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  38.26 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  36.31 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  37.84 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  38.26 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  37.16 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  36.77 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  44.64 
 
 
145 aa  82.8  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  36.94 
 
 
155 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  36.49 
 
 
153 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1800  ribonuclease H  37.61 
 
 
183 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  35.66 
 
 
155 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  32 
 
 
149 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  36.05 
 
 
154 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  38.26 
 
 
146 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  35.14 
 
 
148 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  35.66 
 
 
155 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1879  ribonuclease H  36.7 
 
 
183 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  37.67 
 
 
155 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2077  ribonuclease H  35.78 
 
 
183 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  35.03 
 
 
161 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  33.54 
 
 
154 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  40.37 
 
 
223 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  35.66 
 
 
155 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  35.66 
 
 
155 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  35.66 
 
 
155 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  35.67 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  32.04 
 
 
163 aa  81.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  37.75 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  34.93 
 
 
154 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  43.69 
 
 
145 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  42.15 
 
 
149 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  36.91 
 
 
145 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  40.74 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  40.74 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  36.55 
 
 
142 aa  81.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  40.95 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  36.49 
 
 
154 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  37.41 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  40.74 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  36.73 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  36.73 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>