More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1775 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  41.75 
 
 
864 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  49.82 
 
 
878 aa  877    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  98.25 
 
 
859 aa  1749    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  100 
 
 
859 aa  1772    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.25 
 
 
868 aa  694    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  41.23 
 
 
850 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  44.8 
 
 
857 aa  733    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  42.69 
 
 
868 aa  691    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  30.84 
 
 
471 aa  230  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  35.04 
 
 
416 aa  225  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  30.95 
 
 
471 aa  224  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  30.43 
 
 
455 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  31.13 
 
 
471 aa  222  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  36.26 
 
 
402 aa  221  6e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  31.34 
 
 
471 aa  220  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  31.09 
 
 
458 aa  220  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  31.32 
 
 
458 aa  219  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  31.7 
 
 
454 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  32.25 
 
 
471 aa  217  8e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  31.3 
 
 
455 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  30.95 
 
 
471 aa  213  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  36.44 
 
 
410 aa  213  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.13 
 
 
449 aa  213  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  34.31 
 
 
409 aa  207  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  34.23 
 
 
421 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  31.6 
 
 
456 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  34.51 
 
 
406 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  29.98 
 
 
450 aa  205  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  33.07 
 
 
425 aa  204  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  30.7 
 
 
456 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  29.91 
 
 
461 aa  200  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  30.82 
 
 
471 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  32.71 
 
 
421 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  32.11 
 
 
452 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  29.22 
 
 
541 aa  198  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  29.1 
 
 
450 aa  197  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.88 
 
 
818 aa  197  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  29.48 
 
 
461 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  29.48 
 
 
461 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  34.49 
 
 
398 aa  196  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.09 
 
 
818 aa  196  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  34.14 
 
 
420 aa  195  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  30.65 
 
 
449 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  30.65 
 
 
449 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  30.65 
 
 
449 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  34.05 
 
 
434 aa  195  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  30.65 
 
 
449 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  32.11 
 
 
451 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  30.65 
 
 
449 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  29.64 
 
 
451 aa  193  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  30.74 
 
 
449 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  30.74 
 
 
449 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  30.74 
 
 
449 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 
412 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 
406 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  32.55 
 
 
419 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  30.74 
 
 
449 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  30.74 
 
 
449 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  32.18 
 
 
420 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  32.33 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  31.9 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.89 
 
 
820 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  32.8 
 
 
419 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  31.91 
 
 
420 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 
420 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  32.18 
 
 
420 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.89 
 
 
820 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  31.9 
 
 
451 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 
420 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 
420 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.89 
 
 
820 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  31.91 
 
 
420 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.89 
 
 
820 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  35.64 
 
 
386 aa  191  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  30.52 
 
 
449 aa  191  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  31.26 
 
 
466 aa  190  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.89 
 
 
820 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.19 
 
 
819 aa  190  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  30.52 
 
 
449 aa  190  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 
420 aa  190  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  30.52 
 
 
449 aa  190  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  31.03 
 
 
449 aa  190  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  32.18 
 
 
451 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  34.48 
 
 
402 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  33.6 
 
 
407 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  31.9 
 
 
451 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  31.85 
 
 
451 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.19 
 
 
819 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  34.67 
 
 
402 aa  189  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  32.48 
 
 
452 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  33.93 
 
 
429 aa  189  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.31 
 
 
819 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  32.8 
 
 
420 aa  188  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  34.06 
 
 
386 aa  188  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.31 
 
 
819 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  32.11 
 
 
412 aa  189  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  34.24 
 
 
416 aa  188  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  31.68 
 
 
451 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.31 
 
 
819 aa  189  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  31.68 
 
 
451 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>