More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2542 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  100 
 
 
357 aa  729  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  100 
 
 
353 aa  719  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.8038e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  100 
 
 
353 aa  719  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  3.81188e-11  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  74.93 
 
 
369 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  5.33703e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  74.65 
 
 
358 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  74.37 
 
 
369 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  74.37 
 
 
358 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  73.24 
 
 
354 aa  521  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.16879e-08  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  74.44 
 
 
371 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.86695e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  73.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.88885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  76.69 
 
 
351 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.45833e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  73.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.4176e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  73.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.0212e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  74.37 
 
 
358 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.95857e-08  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  73.24 
 
 
365 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.98773e-08  unclonable  2.77772e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  73.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.93272e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  73.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  74.5 
 
 
350 aa  515  1e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.3965e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  73.33 
 
 
358 aa  506  1e-142  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.40093e-10  decreased coverage  5.07763e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  71.47 
 
 
355 aa  488  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  3.42607e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  70.25 
 
 
354 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.18487e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  71.04 
 
 
361 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.65079e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  70.03 
 
 
366 aa  464  1e-130  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  43.45 
 
 
355 aa  263  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  6.58717e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.56 
 
 
367 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 
373 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  31.04 
 
 
342 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.12 
 
 
355 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  55.38 
 
 
225 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.5 
 
 
321 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  30.34 
 
 
320 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  32.58 
 
 
387 aa  132  7e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  29.02 
 
 
331 aa  132  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  51.15 
 
 
209 aa  131  2e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  51.15 
 
 
224 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  51.15 
 
 
224 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  51.15 
 
 
224 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  51.15 
 
 
224 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  51.15 
 
 
224 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  50.38 
 
 
224 aa  130  4e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  51.15 
 
 
179 aa  130  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  30.51 
 
 
318 aa  129  7e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  31.56 
 
 
376 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  5.38127e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  49.63 
 
 
232 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  49.62 
 
 
222 aa  122  1e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  49.62 
 
 
222 aa  122  1e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  49.62 
 
 
222 aa  122  1e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.62 
 
 
222 aa  122  1e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  28.34 
 
 
356 aa  121  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  48.85 
 
 
222 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  48.85 
 
 
222 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  48.85 
 
 
222 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  34.84 
 
 
363 aa  120  5e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.10923e-09  unclonable  2.19993e-07 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  28.49 
 
 
330 aa  117  4e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  28.24 
 
 
321 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  47.2 
 
 
831 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  44.44 
 
 
219 aa  112  1e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  44.44 
 
 
217 aa  112  1e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  45.6 
 
 
831 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.03 
 
 
215 aa  111  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  48.03 
 
 
215 aa  111  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  45.6 
 
 
830 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  44.8 
 
 
831 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  44.8 
 
 
831 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  47.24 
 
 
215 aa  110  4e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  47.33 
 
 
830 aa  110  4e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  28.96 
 
 
334 aa  109  9e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  27.05 
 
 
326 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.75354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  28.71 
 
 
333 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  26.01 
 
 
369 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  25.07 
 
 
324 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
187 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  1.42767e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.74 
 
 
298 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 
276 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.36 
 
 
276 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.36 
 
 
271 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.36 
 
 
276 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  41.36 
 
 
276 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  41.36 
 
 
276 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  41.36 
 
 
276 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  41.36 
 
 
252 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  46.61 
 
 
278 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.2 
 
 
235 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 
216 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  42.28 
 
 
236 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 
276 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  42.28 
 
 
236 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  41.46 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  42.28 
 
 
236 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.85 
 
 
188 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  8.29076e-12  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  41.46 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  41.46 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  41.46 
 
 
223 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  40.91 
 
 
218 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  9.37501e-05  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  38.41 
 
 
207 aa  94  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.3 
 
 
242 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 
218 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 
218 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  40.16 
 
 
273 aa  90.9  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>