162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0207 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  100 
 
 
425 aa  852    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  84.83 
 
 
428 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  29.17 
 
 
445 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  26.62 
 
 
437 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.86 
 
 
431 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  26.85 
 
 
438 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.96 
 
 
438 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.17 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.42 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.73 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.78 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.87 
 
 
458 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.49 
 
 
453 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  26.7 
 
 
448 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.63 
 
 
451 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.12 
 
 
472 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  25.56 
 
 
441 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.59 
 
 
454 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.09 
 
 
448 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.09 
 
 
456 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.64 
 
 
447 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
456 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.38 
 
 
456 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.15 
 
 
474 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.38 
 
 
457 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.19 
 
 
454 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.97 
 
 
455 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.7 
 
 
456 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  24.38 
 
 
438 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.07 
 
 
454 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.07 
 
 
454 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.9 
 
 
453 aa  99.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  25.74 
 
 
500 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  29 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  25.39 
 
 
454 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.06 
 
 
457 aa  97.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  25.06 
 
 
471 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.39 
 
 
487 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  26.65 
 
 
441 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  26.58 
 
 
477 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  24.35 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  24.35 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.43 
 
 
473 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  26.25 
 
 
781 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.97 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.86 
 
 
475 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.99 
 
 
475 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.33 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  25.83 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  23.76 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.84 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.29 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.54 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.28 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.09 
 
 
502 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
657 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  23.92 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  26.62 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.47 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  22.57 
 
 
665 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  25.63 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.63 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.23 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.44 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.44 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.56 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.84 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.83 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  25.06 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  23.65 
 
 
505 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  25.06 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.69 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  25.27 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.12 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  23.13 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  21.74 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  24.52 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  22.99 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  23.97 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03169  flagellar capping protein  28.04 
 
 
670 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  23.74 
 
 
467 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.43 
 
 
487 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  23.74 
 
 
467 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  23.87 
 
 
666 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  24.89 
 
 
685 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  22.63 
 
 
504 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.63 
 
 
504 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.98 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  27.81 
 
 
663 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.35 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  23.2 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  25.93 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  23.44 
 
 
677 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.54 
 
 
504 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  22.71 
 
 
513 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  22.97 
 
 
466 aa  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  23.58 
 
 
692 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  22.6 
 
 
507 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  22.6 
 
 
507 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  22.6 
 
 
507 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>