221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1141 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 391 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 391 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  98.98 
 
 		 391 aa  786    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  43.15 
 
 		 391 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  43.67 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  43.01 
 
 		 391 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  43.01 
 
 		 391 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  42.23 
 
 		 391 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  37.53 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  39.16 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  37.53 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  39.16 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  39.16 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  39.16 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  39.16 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  39.16 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  39.16 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  34.28 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  35.98 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  35.98 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  34.65 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  34.65 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.45 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.03 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.48 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.66 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  27.53 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.32 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  26.07 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.37 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.14 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.14 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.14 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.14 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.23 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  25.5 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.87 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25.63 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.2 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.76 
 
 		 347 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.63 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25.86 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.13 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.69 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  24.35 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.32 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.12 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  24.34 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.25 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.93 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  22.8 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  22.8 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.75 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  25.6 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  23.25 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  24.6 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  26.18 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  25.47 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.98 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  26.9 
 
 		 517 aa  59.7  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  24.14 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  24.59 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  22.94 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  24.76 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  25.23 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.88 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  23.47 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  24.46 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  24.69 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  21.52 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24.88 
 
 		 324 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  25.57 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  22.93 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  22.28 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.11 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  25.52 
 
 		 569 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  22.32 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.77 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  22.11 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  26.32 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  26.54 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  26.67 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  25.68 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  38.36 
 
 		 231 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  38.46 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  25.93 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>