More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1863 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  100 
 
 		 431 aa  849    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  98.83 
 
 		 429 aa  834    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  65.02 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  59.95 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  41.41 
 
 		 428 aa  329  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  41.51 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  40.38 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  41.92 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  42.15 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.78 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  41.55 
 
 		 427 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  40.65 
 
 		 425 aa  316  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  41.45 
 
 		 428 aa  316  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  41.59 
 
 		 429 aa  316  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  41.51 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  40.88 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  42.02 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  42.12 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  41.36 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  41.36 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  42.03 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  41.78 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  41.36 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  41.45 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  41.59 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  41.36 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  41.36 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  41.78 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  41.36 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  41.55 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  40.88 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  40.88 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  41.59 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  41.45 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  42.02 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  41.57 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  41.51 
 
 		 428 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  41.51 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  42.89 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  40.8 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  41.27 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  46.36 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  41.22 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  41.27 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  39.14 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  40.8 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  45.26 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  43.69 
 
 		 431 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  42.69 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  47.93 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  42.03 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  44.69 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0017  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  45.73 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  40.27 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  44.57 
 
 		 434 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  38.75 
 
 		 445 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  44.36 
 
 		 437 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  44.69 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  44.93 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  38.55 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  39.86 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  43.45 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  44.44 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  44.69 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  39.02 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  45.56 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  39.44 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  38.58 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  42.42 
 
 		 429 aa  276  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.83 
 
 		 462 aa  276  7e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  41.63 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0197  sun protein  44.55 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  37.5 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  35.42 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  35.19 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  41.06 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.57 
 
 		 430 aa  259  7e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.53 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  42.07 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2626  sun protein  43.56 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4003  sun protein  50.84 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000045232 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  41.55 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  41.55 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3243  sun protein  48.96 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3894  sun protein  48.66 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4528  sun protein  41.69 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0272  Sun protein  49.09 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.432064  decreased coverage  0.0030391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0184  sun protein  37.35 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0392  sun protein  40 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3590  sun protein  45.06 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0840523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0513  sun protein  43.98 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426723 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2382  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.97 
 
 		 528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0028  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.2 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0591  sun protein  48.19 
 
 		 442 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4436  sun protein  38.73 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  39.54 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3674  sun protein  39.03 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  35.13 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3632  sun protein  42.47 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.10429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>