More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0046 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  71.43 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  65.55 
 
 		 123 aa  159  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  59.17 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  60.33 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  57.85 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  55.74 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  56.1 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  53.97 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  56.3 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  57.8 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0984  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.052829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  46.67 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  47.69 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 133 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  48.67 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  45.53 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  42.98 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  40.94 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  40.94 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.63 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  42.75 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  43.09 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>