137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2922 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 		 183 aa  357  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  55.93 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  55.7 
 
 		 201 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  55.7 
 
 		 201 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  58.33 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  54.43 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  52.5 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  52.86 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.35 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.65 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.97 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.4 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  42.47 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.24 
 
 		 165 aa  91.3  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  34.36 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.36 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.69 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.17 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.05 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.69 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.69 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.97 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.69 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  35.63 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.9 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  37.5 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  38.51 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.78 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  39.47 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.73 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.17 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.11 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.33 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.98 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.67 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  34.51 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  34.25 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.71 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  37.7 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.69 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.9 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.39 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.13 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  38.68 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.62 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.84 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.82 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  32.68 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.72 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.17 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.79 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.29 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  37.82 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.71 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.16 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.43 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.69 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  31.25 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  32.43 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  38.89 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.04 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  34.19 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  30.81 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  30.49 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  31.05 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  32.97 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.67 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.64 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.36 
 
 		 510 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  30.11 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.74 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  33.57 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.74 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  30.32 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  28.42 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.67 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  33.63 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.12 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  32.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  32.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  32.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.33 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  31.65 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  32.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  32.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  32.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  32.89 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  32.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.33 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  31.33 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>