252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1300 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  80.71 
 
 
317 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  66.8 
 
 
318 aa  351  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  67.49 
 
 
318 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  67.49 
 
 
318 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  67.49 
 
 
318 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  67.49 
 
 
318 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  67.49 
 
 
318 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  67.49 
 
 
318 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  67.49 
 
 
318 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  63.28 
 
 
319 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.47099e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  61.57 
 
 
321 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  63.81 
 
 
336 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  63.81 
 
 
319 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  63.81 
 
 
319 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  61.96 
 
 
319 aa  331  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  63.42 
 
 
319 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  62.26 
 
 
319 aa  329  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  61.48 
 
 
339 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  61.87 
 
 
339 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  60.94 
 
 
332 aa  324  8e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  61.48 
 
 
319 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  64.05 
 
 
319 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  64.05 
 
 
319 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  61.11 
 
 
321 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  64.46 
 
 
319 aa  320  1e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.73109e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  63.64 
 
 
319 aa  320  1e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  61.26 
 
 
319 aa  320  2e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  64.05 
 
 
319 aa  318  4e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  59.53 
 
 
319 aa  313  2e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  57.75 
 
 
321 aa  311  6e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  61.98 
 
 
335 aa  303  2e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  61.98 
 
 
335 aa  303  2e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  54.33 
 
 
316 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  52.36 
 
 
318 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  53.54 
 
 
316 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  53.15 
 
 
317 aa  282  4e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  50.79 
 
 
317 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  51.97 
 
 
316 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  53.56 
 
 
329 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  54.25 
 
 
316 aa  279  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  50.98 
 
 
318 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  53.28 
 
 
316 aa  268  6e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  53.28 
 
 
320 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  50.97 
 
 
319 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  50.62 
 
 
319 aa  235  5e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  50.82 
 
 
320 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  48.06 
 
 
321 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.38 
 
 
319 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  50.61 
 
 
322 aa  221  7e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.2 
 
 
298 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 
299 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
312 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  35.35 
 
 
287 aa  113  4e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  31.41 
 
 
353 aa  108  8e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
313 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
332 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
292 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.386e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 
302 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
305 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  34.91 
 
 
318 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  28.52 
 
 
362 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.5 
 
 
310 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 
318 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
308 aa  99  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
318 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 
333 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  31.1 
 
 
644 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  27.76 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.14 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
318 aa  92.8  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.14 
 
 
323 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  29.83 
 
 
637 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  31 
 
 
325 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 
310 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 
321 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 
342 aa  86.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
311 aa  85.9  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
313 aa  84.7  1e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
319 aa  83.6  3e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.85 
 
 
438 aa  83.2  4e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
310 aa  81.3  1e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
295 aa  80.5  3e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
312 aa  80.5  3e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 
319 aa  79.7  5e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
310 aa  78.6  9e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
310 aa  77.8  2e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
331 aa  77.4  2e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
337 aa  77  3e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
315 aa  76.6  4e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.24 
 
 
294 aa  75.9  6e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
315 aa  75.9  6e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
287 aa  75.9  6e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 
249 aa  75.9  7e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
342 aa  75.9  7e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>