More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0956 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
337 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  70.32 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  67 
 
 
321 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  60.75 
 
 
324 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  62.76 
 
 
329 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  62.83 
 
 
336 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  62.71 
 
 
336 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  61.64 
 
 
311 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  63.99 
 
 
334 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  56.42 
 
 
303 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  57.77 
 
 
321 aa  349  5e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  58.16 
 
 
300 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  55.99 
 
 
297 aa  331  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  56.38 
 
 
284 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  56.54 
 
 
290 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  55.36 
 
 
284 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  52.13 
 
 
315 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  56.88 
 
 
289 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  53.55 
 
 
281 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  54.09 
 
 
283 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  54.26 
 
 
356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  53.68 
 
 
294 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  54.09 
 
 
284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  48.8 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  50.34 
 
 
301 aa  301  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.11 
 
 
639 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  51.93 
 
 
293 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  52.3 
 
 
293 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  51.81 
 
 
296 aa  298  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  54.26 
 
 
289 aa  297  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.4 
 
 
290 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  47.47 
 
 
306 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  53.79 
 
 
300 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  53.66 
 
 
290 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  53.66 
 
 
290 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  53.66 
 
 
290 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  51.86 
 
 
296 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 
308 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 
309 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  47.6 
 
 
323 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  54.58 
 
 
296 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  49.48 
 
 
323 aa  287  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  47.67 
 
 
283 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  52.98 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  52.63 
 
 
287 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  46.71 
 
 
296 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 
296 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  51.58 
 
 
291 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  47.72 
 
 
288 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  45.74 
 
 
303 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  47.42 
 
 
374 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 
290 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
296 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.78 
 
 
335 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 
289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  45.89 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  36.95 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 
297 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  54.62 
 
 
409 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  56.7 
 
 
99 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
279 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  28.22 
 
 
279 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
282 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  29.14 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
294 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
301 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 
288 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  29.41 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
297 aa  89.4  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
308 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.99 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  24.15 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
302 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  29.51 
 
 
298 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
302 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
318 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
287 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  23.42 
 
 
294 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
294 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
294 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  23.53 
 
 
294 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
290 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
339 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
278 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
339 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
295 aa  85.9  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>