More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0006 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  100 
 
 
344 aa  682  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  2.15345e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  70.1 
 
 
348 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  64.54 
 
 
357 aa  398  1e-110  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
328 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  40.98 
 
 
326 aa  221  2e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  39.68 
 
 
334 aa  221  2e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
328 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  40.2 
 
 
328 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.94 
 
 
609 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
343 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  37.05 
 
 
603 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
336 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  41.44 
 
 
359 aa  201  1e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  38.18 
 
 
616 aa  198  1e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  38.13 
 
 
344 aa  197  2e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
333 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  35.86 
 
 
326 aa  185  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
357 aa  184  2e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
366 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  41.84 
 
 
339 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  36 
 
 
331 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  7.69607e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  32 
 
 
368 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  32 
 
 
368 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  35.5 
 
 
313 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.14 
 
 
334 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  35.2 
 
 
336 aa  167  3e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2426  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  33.43 
 
 
368 aa  164  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
318 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  34.58 
 
 
328 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  34.75 
 
 
315 aa  156  5e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  33.03 
 
 
328 aa  154  3e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
326 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
333 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  35.02 
 
 
323 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  35.87 
 
 
327 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  32.39 
 
 
335 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  36.12 
 
 
326 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  30.59 
 
 
315 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  38.6 
 
 
318 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.99 
 
 
297 aa  135  1e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  30.29 
 
 
603 aa  134  2e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
307 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  28.94 
 
 
338 aa  132  1e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.02 
 
 
415 aa  131  1e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  28.78 
 
 
328 aa  131  2e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
348 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 
339 aa  129  5e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  28.62 
 
 
337 aa  129  8e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  29.64 
 
 
324 aa  129  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  31.12 
 
 
463 aa  127  2e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  30.21 
 
 
297 aa  125  8e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  30.12 
 
 
325 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  31.07 
 
 
407 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  31.69 
 
 
344 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  31.97 
 
 
401 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  2.17655e-08 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  30.23 
 
 
324 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  29.41 
 
 
310 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.92686e-06  unclonable  5.58621e-08 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.25 
 
 
328 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  26.3 
 
 
321 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  30.64 
 
 
317 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  31.51 
 
 
349 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  28.44 
 
 
360 aa  122  1e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  30.15 
 
 
319 aa  122  1e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.31 
 
 
443 aa  121  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.56 
 
 
656 aa  121  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0328  inner-membrane translocator  34.31 
 
 
325 aa  121  2e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286891  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
327 aa  120  4e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
319 aa  120  4e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
332 aa  119  8e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  28.97 
 
 
332 aa  118  1e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  30.04 
 
 
328 aa  119  1e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  34.08 
 
 
282 aa  118  2e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  31.6 
 
 
354 aa  117  2e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0512  inner-membrane translocator  27.24 
 
 
307 aa  118  2e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0951798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  31.42 
 
 
333 aa  118  2e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.1 
 
 
407 aa  118  2e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  31.72 
 
 
336 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  28.83 
 
 
341 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  28.37 
 
 
317 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  28.45 
 
 
353 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  33.09 
 
 
330 aa  115  8e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
315 aa  115  9e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  33.74 
 
 
314 aa  115  1e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  27.45 
 
 
332 aa  115  1e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  31.19 
 
 
589 aa  115  1e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 
298 aa  114  2e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 
326 aa  114  2e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  28.1 
 
 
562 aa  114  2e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  29.22 
 
 
389 aa  114  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  30.56 
 
 
324 aa  114  2e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  28.36 
 
 
347 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
331 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
346 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  29.67 
 
 
643 aa  113  4e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  30.45 
 
 
352 aa  113  4e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.38 
 
 
350 aa  113  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  31.39 
 
 
349 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  30.26 
 
 
589 aa  112  7e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1319  inner-membrane translocator  31.3 
 
 
372 aa  112  7e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  29.85 
 
 
340 aa  112  8e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>