65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4415 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 252 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  74.6 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  75.1 
 
 		 251 aa  325  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  63.6 
 
 		 255 aa  288  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  55.47 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  44.4 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  43.21 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  43.21 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  43.21 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  43.39 
 
 		 245 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  42.8 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  42.8 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  42.39 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  39.27 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  41.32 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  45.38 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  41.83 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  38.25 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  41.98 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  39.92 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  41.13 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  35.97 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  37.94 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  37.35 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  37.4 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  35.8 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  37.6 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  37.19 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  36.63 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  36.59 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  35.22 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  37.8 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  34.94 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  33.6 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  32.78 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  32.78 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  37.89 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  32.51 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  30.13 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  30.13 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  30.13 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  29.48 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  29.52 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  29.22 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  28.23 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  22.47 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  29.95 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  29.26 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.19 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  29.27 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29.65 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  23.56 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  24 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  30.48 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>