More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2849 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0464  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  77.04 
 
 
814 aa  1309  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1266  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  55.42 
 
 
825 aa  871  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0963412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3231  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  46.53 
 
 
819 aa  650  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.11 
 
 
814 aa  822  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1080  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.29 
 
 
814 aa  848  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.406718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.18 
 
 
837 aa  638  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1700  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  63.94 
 
 
811 aa  1052  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.575793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  50.88 
 
 
801 aa  796  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.83 
 
 
870 aa  657  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41530  assimilatory nitrite reductase large subunit  72.64 
 
 
816 aa  1204  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1667  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  52.33 
 
 
810 aa  820  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0751233  normal  0.158912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  57.05 
 
 
817 aa  887  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.28 
 
 
816 aa  848  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116537  normal  0.910407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2968  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  56.16 
 
 
831 aa  901  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  54.93 
 
 
811 aa  853  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  83.72 
 
 
821 aa  1423  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2557  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  82.76 
 
 
823 aa  1417  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3276  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  88.2 
 
 
810 aa  1474  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464677  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0558  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  76.79 
 
 
814 aa  1309  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2956  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.21 
 
 
818 aa  882  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1990  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  48.99 
 
 
800 aa  768  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.68 
 
 
808 aa  889  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  48.65 
 
 
801 aa  778  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2107  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  80.05 
 
 
823 aa  1370  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.614083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1407  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  81.55 
 
 
815 aa  1396  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2839  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  78.39 
 
 
821 aa  1337  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.184658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0099  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  76.79 
 
 
814 aa  1309  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2593  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  74.97 
 
 
825 aa  1307  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2317  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  84.15 
 
 
819 aa  1423  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.551763  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2919  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  76.79 
 
 
814 aa  1309  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1490  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  76.79 
 
 
814 aa  1309  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3242  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.4 
 
 
819 aa  648  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3013  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.02 
 
 
823 aa  638  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1000  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  72.32 
 
 
816 aa  1246  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4525  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.13 
 
 
820 aa  868  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.927735  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1707  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  57.05 
 
 
839 aa  893  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  48.65 
 
 
801 aa  778  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  51.71 
 
 
810 aa  805  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1114  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.5 
 
 
812 aa  976  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3525  assimilatory nitrite reductase large subunit  70.41 
 
 
816 aa  1194  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2096  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  72.66 
 
 
818 aa  1238  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3293  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.53 
 
 
819 aa  650  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.2 
 
 
822 aa  654  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742948  normal  0.535106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0573  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  76.54 
 
 
814 aa  1304  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  53.45 
 
 
815 aa  868  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23370  Assimilatory Nitrite reductase,large subunit; NasA  69.91 
 
 
816 aa  1157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.55 
 
 
801 aa  742  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0592  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  64.13 
 
 
820 aa  1080  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3130  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  76.79 
 
 
814 aa  1309  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  49.37 
 
 
801 aa  771  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1781  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  73.37 
 
 
823 aa  1221  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  78.27 
 
 
821 aa  1336  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0741  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  76.67 
 
 
814 aa  1306  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2309  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  72.86 
 
 
818 aa  1231  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  49.24 
 
 
801 aa  771  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  49.12 
 
 
801 aa  770  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  49.24 
 
 
801 aa  772  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.48 
 
 
834 aa  638  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0816  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  72.24 
 
 
814 aa  1225  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359061  normal  0.0137371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  49.24 
 
 
801 aa  769  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  63.54 
 
 
826 aa  1073  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1142  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  70.15 
 
 
825 aa  1179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.861226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1629  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.65 
 
 
816 aa  854  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.899619  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  49.12 
 
 
801 aa  770  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3528  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  99.88 
 
 
820 aa  1690  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.31 
 
 
827 aa  635  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2849  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  100 
 
 
820 aa  1691  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0719  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  52.81 
 
 
820 aa  820  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.825422  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3774  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.22 
 
 
813 aa  638  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.541337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  49.37 
 
 
801 aa  774  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  49.12 
 
 
801 aa  770  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3275  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.55 
 
 
846 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1392  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.42 
 
 
839 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2371  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.76 
 
 
426 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.08 
 
 
409 aa  573  1e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.856464  hitchhiker  0.00707192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2302  assimilatory nitrate reductase electron transfer subunit domain protein  69.83 
 
 
409 aa  573  1e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.07 
 
 
410 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4166  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.07 
 
 
410 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03164  flavoprotein FAD oxidoreductase  63.57 
 
 
409 aa  518  1e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229065  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4862  assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  61.4 
 
 
413 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4820  assimilatory nitrate reductase (NADH) small subunit  60.1 
 
 
413 aa  493  1e-138  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713443  normal  0.685908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.17 
 
 
837 aa  495  1e-138  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.12 
 
 
830 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3956  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  36.12 
 
 
848 aa  467  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.35 
 
 
1373 aa  467  1e-130  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5406  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.81 
 
 
837 aa  469  1e-130  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0235  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.12 
 
 
848 aa  467  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5924  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  38.38 
 
 
814 aa  466  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0194616  normal  0.0886236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2176  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.96 
 
 
833 aa  462  1e-128  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000870313  hitchhiker  9.85708e-06 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  36.61 
 
 
971 aa  459  1e-128  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.6 
 
 
837 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2058  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.45 
 
 
823 aa  454  1e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2355  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  35.89 
 
 
851 aa  453  1e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000467029  normal  0.479007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2412  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.94 
 
 
846 aa  453  1e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  4.34604e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.48 
 
 
1386 aa  453  1e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4818  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H-binding) large subunit precursor  36.58 
 
 
853 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4860  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  36.65 
 
 
853 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.47 
 
 
1381 aa  446  1e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  36.72 
 
 
1328 aa  447  1e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.45 
 
 
837 aa  447  1e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>