49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0047 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  61.08 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  59.8 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  45.05 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  37.07 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  34.8 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  29.49 
 
 		 249 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  29.91 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  31.03 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  28.77 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  31.8 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  31.05 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  31.22 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  31.43 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  29.47 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  28.31 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  32.09 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  28.77 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  27.23 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  29.77 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  29.47 
 
 		 393 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  28.23 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  26.46 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  28.23 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  30.72 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25.66 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  29.15 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  27.44 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  26.51 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  26.37 
 
 		 332 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.3 
 
 		 338 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  28.3 
 
 		 338 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  28.19 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  34.26 
 
 		 362 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  24.09 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  22.01 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  26.05 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.33 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  28.05 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  25.58 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  31.13 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  29.82 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  26.5 
 
 		 334 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  33.8 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  27.36 
 
 		 339 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>