More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2454 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 467 aa  924    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  40.99 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  38.79 
 
 		 513 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  34.42 
 
 		 563 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  37.53 
 
 		 556 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.31 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.21 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.29 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 		 516 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  38.13 
 
 		 520 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 		 523 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  39.81 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  36.28 
 
 		 527 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  35.36 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  35.53 
 
 		 529 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.4 
 
 		 586 aa  239  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  36.51 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  36.51 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  36.51 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  37.38 
 
 		 521 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.62 
 
 		 518 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.26 
 
 		 568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  32.04 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  35.16 
 
 		 584 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  34.15 
 
 		 554 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  38.15 
 
 		 520 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.5 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  34.88 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.32 
 
 		 521 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 		 579 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.73 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  31.86 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  31.86 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 		 531 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.59 
 
 		 557 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 484 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  31.05 
 
 		 484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.69 
 
 		 572 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  34 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.66 
 
 		 540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.62 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  32.96 
 
 		 531 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.9 
 
 		 534 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  32.74 
 
 		 538 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  35.33 
 
 		 545 aa  206  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.86 
 
 		 524 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  32.33 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  30.25 
 
 		 583 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.44 
 
 		 565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  28.35 
 
 		 559 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.97 
 
 		 564 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.98 
 
 		 470 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  48.36 
 
 		 572 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.18 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.78 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.78 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27 
 
 		 470 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.78 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.78 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.78 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.76 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  31.18 
 
 		 534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  32.14 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.78 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  29.45 
 
 		 466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 		 464 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.79 
 
 		 471 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  27.65 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  30.75 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.19 
 
 		 475 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.17 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.05 
 
 		 890 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  34.93 
 
 		 546 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.45 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.05 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  28.54 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.77 
 
 		 464 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 		 474 aa  176  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.27 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.27 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.23 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.5 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  31.5 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>