More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1627 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
462 aa  941  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  43.38 
 
 
491 aa  399  1e-110  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  45.3 
 
 
463 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  44.49 
 
 
474 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  41.26 
 
 
507 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  42.14 
 
 
458 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  41.23 
 
 
445 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  41.1 
 
 
447 aa  355  9e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  39.15 
 
 
467 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  37.88 
 
 
448 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  37.88 
 
 
448 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  38.34 
 
 
445 aa  338  1e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  44.75 
 
 
436 aa  337  2e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  36.16 
 
 
446 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  41.23 
 
 
469 aa  314  2e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  37.63 
 
 
467 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  34.96 
 
 
464 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  36.43 
 
 
476 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.49333e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  38.73 
 
 
463 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  35.98 
 
 
466 aa  284  2e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  9.64515e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  37.23 
 
 
474 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  35.67 
 
 
446 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  37.3 
 
 
444 aa  263  6e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  34.28 
 
 
445 aa  260  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  34.85 
 
 
451 aa  259  5e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  34.85 
 
 
451 aa  259  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  34.68 
 
 
437 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  34.68 
 
 
437 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.98 
 
 
452 aa  257  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.45 
 
 
455 aa  255  1e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.2325e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  33.85 
 
 
441 aa  253  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  31.95 
 
 
447 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  33.26 
 
 
437 aa  251  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.76 
 
 
455 aa  246  5e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.83 
 
 
449 aa  245  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  31.85 
 
 
443 aa  237  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.65712e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  38.22 
 
 
456 aa  236  5e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  34.8 
 
 
744 aa  233  7e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.1 
 
 
445 aa  229  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.62 
 
 
490 aa  198  2e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  34.93 
 
 
430 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88378e-11 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.03 
 
 
445 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  31.8 
 
 
424 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  29.98 
 
 
412 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  33.04 
 
 
472 aa  184  2e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85492e-07 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  32.29 
 
 
411 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  31.45 
 
 
429 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  35.7 
 
 
421 aa  183  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  32.29 
 
 
418 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  34.07 
 
 
429 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  29.74 
 
 
412 aa  176  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  34.38 
 
 
416 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  33.5 
 
 
417 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  30.43 
 
 
418 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  31.85 
 
 
425 aa  167  3e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  30.05 
 
 
413 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  30.3 
 
 
408 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  30.3 
 
 
408 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  30.07 
 
 
408 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  29.69 
 
 
425 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  31.72 
 
 
394 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  30.55 
 
 
420 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  29.3 
 
 
406 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  30.55 
 
 
415 aa  149  1e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  28.54 
 
 
470 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  3.99076e-06  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  32.2 
 
 
408 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  29.37 
 
 
410 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1829  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.23 
 
 
463 aa  78.2  3e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0480  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  23.37 
 
 
459 aa  77  7e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.7898e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.36 
 
 
455 aa  76.3  1e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.94 
 
 
455 aa  75.5  2e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08860  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  36.62 
 
 
464 aa  70.1  8e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0311093  unclonable  2.15103e-09 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0725  UDP-N-acetylmuramate  22.71 
 
 
466 aa  69.7  1e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.729179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  31.43 
 
 
489 aa  69.3  1e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2605  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.06 
 
 
458 aa  68.9  2e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0509  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.26 
 
 
461 aa  68.6  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3973  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.63 
 
 
458 aa  68.2  3e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.9 
 
 
461 aa  68.6  3e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  26.76 
 
 
471 aa  68.2  3e-10  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3426  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.25 
 
 
471 aa  67.4  5e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.294637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.15 
 
 
491 aa  67.4  5e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2835  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.45 
 
 
465 aa  67  6e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0068259  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0489  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.45 
 
 
465 aa  67  6e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455446  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0464  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.45 
 
 
465 aa  67  7e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  22.76 
 
 
473 aa  67  7e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  5.96507e-12 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0587  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.08 
 
 
449 aa  67  7e-10  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2978  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.5 
 
 
475 aa  66.2  1e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  20.39 
 
 
457 aa  65.9  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.30391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2094  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  33.1 
 
 
475 aa  65.5  2e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0467874  hitchhiker  5.30734e-06 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3127  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.27 
 
 
471 aa  65.9  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4218  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.68 
 
 
488 aa  64.3  4e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.81 
 
 
468 aa  64.3  5e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3088  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.18 
 
 
483 aa  64.3  5e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.47524  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2843  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23 
 
 
483 aa  63.9  5e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16560  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  32.68 
 
 
518 aa  63.9  5e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.351525  normal  0.0165029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2723  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.18 
 
 
483 aa  64.3  5e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2502  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.97 
 
 
457 aa  63.9  6e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3488  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.79 
 
 
468 aa  63.5  7e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1484  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  23.7 
 
 
491 aa  63.2  9e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2816  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.97 
 
 
466 aa  63.2  9e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>