More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0470 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  66.1 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  61.45 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  62.41 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  57.2 
 
 		 265 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  56.44 
 
 		 265 aa  285  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  54.23 
 
 		 259 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  55.68 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  52.3 
 
 		 282 aa  268  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  52.54 
 
 		 275 aa  261  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  50.19 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  52.08 
 
 		 264 aa  251  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  51.53 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  52.83 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  52.45 
 
 		 266 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  50.75 
 
 		 291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  48.72 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  47.91 
 
 		 263 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  48.86 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  48.48 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  50.18 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  46.59 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  48.15 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  47.01 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  47.04 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  47.27 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  47.33 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  46.15 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  42.45 
 
 		 316 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  45.86 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  46.24 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  46.04 
 
 		 275 aa  208  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  45.38 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  44.23 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  45.7 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  44.83 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  43.56 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  43.73 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  43.18 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  45 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 		 255 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  46.01 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  46.01 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  40.46 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  44.27 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  43.3 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  41.92 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  45.25 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  45.08 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  40.08 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  37.97 
 
 		 261 aa  192  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  45.08 
 
 		 264 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  43.4 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  42.15 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  44.62 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  45.38 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  40.44 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  42.97 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  37.36 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  37.36 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  40.52 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  41.13 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  42.15 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  39.7 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  40.46 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  38.81 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 		 258 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 261 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  40.91 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.76 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  41.15 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  41.54 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  40.07 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  40.66 
 
 		 275 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  41.57 
 
 		 263 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  35.32 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  36.09 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  38.81 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  39.08 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  40.81 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>