More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1327 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 637 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 636 aa  680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 636 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 640 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 635 aa  691    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 640 aa  700    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 637 aa  676    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 640 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 639 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 639 aa  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 639 aa  705    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 638 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 639 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 639 aa  693    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 636 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 638 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 631 aa  675    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 645 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 639 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 643 aa  660    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 640 aa  682    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 634 aa  635    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 633 aa  716    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 636 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 640 aa  839    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 635 aa  730    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 645 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 635 aa  701    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 639 aa  708    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 634 aa  730    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 640 aa  702    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 639 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  72.76 
 
 		 638 aa  1000    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 634 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 635 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 640 aa  910    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 644 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 635 aa  718    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 636 aa  1309    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 644 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 646 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 636 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 		 640 aa  908    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 644 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 644 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 662 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 637 aa  628  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  52.5 
 
 		 586 aa  631  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 644 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 635 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 646 aa  626  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 637 aa  626  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 584 aa  623  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 635 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 649 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 641 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 640 aa  618  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 638 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 647 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 635 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 643 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 644 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 633 aa  621  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 652 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 635 aa  618  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 635 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 635 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 643 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  52.2 
 
 		 586 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 643 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 635 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 644 aa  611  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 669 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 645 aa  609  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 648 aa  611  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>