More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0972 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  73.47 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  73.47 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  72.11 
 
 		 148 aa  210  7e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  69.59 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 146 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 146 aa  176  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  66.89 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 		 146 aa  166  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  60.54 
 
 		 146 aa  166  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  61.22 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  60.54 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  59.18 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  62.16 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  58.5 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  56.08 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  60.14 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  58.78 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  59.18 
 
 		 146 aa  153  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  56.76 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 172 aa  147  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 146 aa  146  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  56.76 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  53.74 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  55.86 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  57.43 
 
 		 146 aa  141  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 152 aa  137  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  47.92 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  53.15 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  52.41 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 184 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  52.21 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  43.05 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 162 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>