More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0409 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 439 aa  893    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  63.4 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 476 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  30.96 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 463 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  29.62 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.85 
 
 		 473 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  27.82 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.49 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 456 aa  149  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 476 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.08 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 290 aa  110  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 365 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.96 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.44 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.44 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.66 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.96 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  22.17 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25.42 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  27.37 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  27.37 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.19 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.37 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.37 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 463 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 463 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.57 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.57 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.22 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  22.89 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.66 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.66 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.94 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.23 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  23.01 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  21.9 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>