59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2072 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  100 
 
 		 577 aa  1174    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  57.63 
 
 		 580 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  57.02 
 
 		 580 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  56.13 
 
 		 570 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  55.92 
 
 		 584 aa  601  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  51.57 
 
 		 575 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  50.44 
 
 		 566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  52.6 
 
 		 574 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  49.74 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  49.04 
 
 		 582 aa  535  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  50.35 
 
 		 568 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  50.35 
 
 		 568 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  44.07 
 
 		 551 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  41.2 
 
 		 728 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  40.83 
 
 		 728 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  38.43 
 
 		 732 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  39.89 
 
 		 734 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  37.95 
 
 		 729 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  37.52 
 
 		 729 aa  349  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 731 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  33.58 
 
 		 674 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  40.62 
 
 		 695 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  34.97 
 
 		 749 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  34.8 
 
 		 749 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  35.85 
 
 		 747 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 		 726 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  37.1 
 
 		 726 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  37.23 
 
 		 726 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 		 744 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 759 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  38.59 
 
 		 722 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  33.16 
 
 		 744 aa  318  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  31.79 
 
 		 1042 aa  313  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  35.39 
 
 		 743 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  31.46 
 
 		 829 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 1162 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 		 994 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 1006 aa  198  3e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 1000 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 1022 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 609 aa  94.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 1187 aa  66.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  24.46 
 
 		 902 aa  62.4  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 		 606 aa  59.7  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 		 485 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  24.45 
 
 		 794 aa  54.3  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 816 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 472 aa  50.8  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 823 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 813 aa  48.9  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  21.33 
 
 		 520 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  21.6 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  25 
 
 		 812 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  25.54 
 
 		 812 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  26.86 
 
 		 766 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 511 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  25.47 
 
 		 542 aa  43.9  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>