More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2341 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 		 171 aa  350  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  65.5 
 
 		 186 aa  229  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  57.79 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  58.78 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.55 
 
 		 453 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  49.03 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  50.66 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  50.55 
 
 		 196 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  44.72 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  49.03 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  46.75 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 160 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  47.59 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  45.12 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  47.8 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  44.24 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  48.03 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  47.4 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  46.41 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  47.3 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  46.71 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  47.74 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  48.32 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.62 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.1 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  47.62 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  45.51 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  44.58 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  44.81 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  44.16 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  44.37 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  41.88 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.48 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  39.19 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1641  phosphotyrosine protein phosphatase  41.56 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  45.81 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  43.05 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  41.9 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 		 164 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  40.67 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.44 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  45.28 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.39 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.91 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.95 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  43.12 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>