116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0147 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
673 aa  1318    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  34.25 
 
 
617 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.64 
 
 
634 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.08 
 
 
591 aa  130  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.64 
 
 
639 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 
639 aa  125  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
837 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.51 
 
 
266 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
242 aa  90.9  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.29 
 
 
328 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
242 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.29 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.61 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.3 
 
 
644 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 
244 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  28.74 
 
 
245 aa  73.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26 
 
 
236 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 
283 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.94 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 
266 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
282 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  26.28 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 
279 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  26.63 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.53 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  26.63 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  26.32 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  26.63 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  26.63 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  26.09 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.13 
 
 
808 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  27.72 
 
 
657 aa  67  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 
269 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
269 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  25.48 
 
 
333 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 
258 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  25.48 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
269 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 
246 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 
265 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 
300 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 
264 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.87 
 
 
231 aa  60.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 
246 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 
265 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.87 
 
 
278 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 
298 aa  59.3  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 
263 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 
263 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.64 
 
 
255 aa  57.8  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 
233 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
257 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.28 
 
 
255 aa  56.6  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 
287 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  25.29 
 
 
333 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 
287 aa  55.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
244 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  26.87 
 
 
330 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.42 
 
 
249 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
282 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
576 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
289 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 
235 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 
244 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 
278 aa  52  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 
261 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 
261 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  29.07 
 
 
273 aa  50.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
226 aa  50.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 
318 aa  50.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  31.53 
 
 
338 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 
259 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.53 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 
249 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
248 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.9 
 
 
300 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 
250 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.91 
 
 
371 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
258 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.23 
 
 
232 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
314 aa  47.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  23.36 
 
 
325 aa  47.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
258 aa  47.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 
255 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.34 
 
 
243 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.21 
 
 
250 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.49 
 
 
334 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 
276 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 
288 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05011  integral plasma membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09740)  24.73 
 
 
949 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0782168  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 
251 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
236 aa  45.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>