More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0008 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  898  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  41.11 
 
 
476 aa  338  1e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.49333e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  38.88 
 
 
464 aa  322  1e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  37.22 
 
 
474 aa  319  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  39.49 
 
 
469 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  36.16 
 
 
462 aa  316  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  37.08 
 
 
463 aa  310  3e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  37.04 
 
 
467 aa  302  7e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  35.89 
 
 
463 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  33.97 
 
 
491 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  37.17 
 
 
458 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  37.69 
 
 
446 aa  289  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  37.16 
 
 
466 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  9.64515e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  37.31 
 
 
474 aa  287  3e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  37.36 
 
 
455 aa  285  2e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  38 
 
 
437 aa  283  6e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  38 
 
 
437 aa  283  6e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  34.44 
 
 
445 aa  276  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  36.3 
 
 
436 aa  273  5e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  36.55 
 
 
437 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  32.25 
 
 
507 aa  267  3e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  38.43 
 
 
467 aa  265  9e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  34.26 
 
 
447 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  34.98 
 
 
744 aa  260  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  33.85 
 
 
448 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  39.37 
 
 
444 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  33.85 
 
 
448 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  32.52 
 
 
445 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  38.44 
 
 
451 aa  254  2e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  35.68 
 
 
456 aa  253  4e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  38.22 
 
 
451 aa  253  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.92 
 
 
449 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.33 
 
 
455 aa  230  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.2325e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  33.33 
 
 
447 aa  228  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  33.49 
 
 
441 aa  221  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  34.27 
 
 
445 aa  219  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  32.65 
 
 
443 aa  210  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.65712e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.64 
 
 
452 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.18 
 
 
445 aa  199  7e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  29.45 
 
 
430 aa  182  8e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88378e-11 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.55 
 
 
445 aa  178  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  29.65 
 
 
429 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  30.58 
 
 
472 aa  171  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85492e-07 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  29.03 
 
 
413 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  28.11 
 
 
408 aa  166  6e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  27.65 
 
 
408 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  27.65 
 
 
408 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.07 
 
 
490 aa  162  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  26.21 
 
 
408 aa  154  3e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  29.16 
 
 
394 aa  154  3e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  26.12 
 
 
411 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  28.68 
 
 
421 aa  148  2e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  27.88 
 
 
412 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  26.59 
 
 
412 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  28.18 
 
 
418 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  27.96 
 
 
425 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  27.88 
 
 
406 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  25.61 
 
 
429 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  26.73 
 
 
416 aa  143  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  27.06 
 
 
417 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  27.58 
 
 
418 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  27.08 
 
 
425 aa  136  6e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  25.94 
 
 
424 aa  128  2e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  26.86 
 
 
410 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  27.36 
 
 
470 aa  120  5e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  3.99076e-06  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  27.27 
 
 
415 aa  116  7e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  26.26 
 
 
420 aa  116  8e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1246  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  28.16 
 
 
464 aa  82.8  1e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0480  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  24.2 
 
 
459 aa  75.9  1e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.7898e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.57 
 
 
455 aa  72  2e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1635  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6- diamin opimelate/D-alanyl-D-alanylligase  20 
 
 
455 aa  69.7  9e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1273  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  20.18 
 
 
498 aa  68.9  2e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.955729  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1204  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  21.17 
 
 
439 aa  67.4  5e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.96 
 
 
493 aa  67  7e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0186e-11 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0587  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.86 
 
 
449 aa  66.6  8e-10  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3631  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  24.46 
 
 
453 aa  66.6  9e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2414  Mur ligase family protein  25.08 
 
 
401 aa  65.1  2e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00339863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1465  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  23.23 
 
 
509 aa  65.1  3e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09100  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  25.41 
 
 
459 aa  64.3  4e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0725  UDP-N-acetylmuramate  22.9 
 
 
466 aa  64.7  4e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.729179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.64 
 
 
493 aa  64.7  4e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.53 
 
 
491 aa  63.9  6e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate ligase  24.68 
 
 
492 aa  63.2  9e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00917658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1251  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  28.38 
 
 
459 aa  63.2  1e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1037  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  21.05 
 
 
484 aa  62.8  1e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  22.51 
 
 
495 aa  62.8  1e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.81 
 
 
479 aa  62.4  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0351  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  21.15 
 
 
457 aa  62.4  2e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0457  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  22.77 
 
 
503 aa  61.6  2e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.217649  normal  0.557266 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0112  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.08 
 
 
427 aa  62  2e-08  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.20925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1250  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  20.68 
 
 
434 aa  62.4  2e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.08446e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  22.37 
 
 
871 aa  61.6  3e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0397  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  23.87 
 
 
499 aa  61.2  3e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2052  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  21.64 
 
 
491 aa  61.2  3e-08  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.28 
 
 
468 aa  61.6  3e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0040  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  23.42 
 
 
518 aa  61.2  3e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3633  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  21.5 
 
 
458 aa  61.2  3e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0816  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  20.75 
 
 
519 aa  61.2  4e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121209  normal  0.512783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0396  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  24.59 
 
 
499 aa  60.8  4e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3524  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetases  21.74 
 
 
530 aa  61.2  4e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>