More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1580 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  79.37 
 
 		 378 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  100 
 
 		 383 aa  794    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  78.42 
 
 		 386 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  78.42 
 
 		 386 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  77.37 
 
 		 389 aa  630  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  78.99 
 
 		 386 aa  630  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  78.04 
 
 		 378 aa  627  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  77.25 
 
 		 378 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  68.27 
 
 		 397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  69.97 
 
 		 381 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  68.7 
 
 		 396 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  69.71 
 
 		 381 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  69.71 
 
 		 381 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  67.91 
 
 		 378 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  68 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  68.9 
 
 		 381 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  67.83 
 
 		 375 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  68.1 
 
 		 375 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  56.3 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  54.21 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  53.25 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  54.21 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  54.43 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  49.19 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  49.87 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.63 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.72 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  46.24 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.47 
 
 		 379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  45.43 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.97 
 
 		 397 aa  319  6e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.55 
 
 		 430 aa  316  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  45.7 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  45.7 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  45.97 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  45.7 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  45.7 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  45.7 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  45.7 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  45.7 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  45.7 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  45.7 
 
 		 382 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.72 
 
 		 382 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  45.01 
 
 		 386 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.34 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.05 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  43.5 
 
 		 374 aa  305  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  41.78 
 
 		 447 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.48 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.48 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  42.38 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.13 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  43.24 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  42.86 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  40 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  42.86 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  40.27 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  39.9 
 
 		 455 aa  294  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.31 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  41.67 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  40.86 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  39.64 
 
 		 431 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  40.21 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.73 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  39.9 
 
 		 544 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  39.89 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.14 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  41.25 
 
 		 447 aa  288  9e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  39.38 
 
 		 442 aa  288  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  40.42 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.82 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.44 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  39.12 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.44 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.3 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  39.69 
 
 		 448 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  40.99 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.27 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.2 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  37.82 
 
 		 429 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  40.36 
 
 		 447 aa  285  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  38.14 
 
 		 439 aa  285  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  40.73 
 
 		 447 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  37.82 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  41.51 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  41.67 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.67 
 
 		 409 aa  282  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  40.85 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  39.79 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  37.14 
 
 		 426 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.58 
 
 		 377 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  40.58 
 
 		 429 aa  278  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.22 
 
 		 380 aa  278  9e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  37.05 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  36.95 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  35.57 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  37.05 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  37.05 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  39.79 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.819839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>