More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1565 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  45.73 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  48.77 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  43.66 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  48.15 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.35 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.85 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  39.88 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  47.58 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  43.88 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  34.18 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  36.11 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  41.61 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  36.65 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  36.6 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  34.59 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  34.59 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  34.59 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  34.59 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  34.59 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  35.22 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  34.59 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  36.88 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  37.16 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  37.08 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  39.31 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  46.55 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  33.01 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  40.71 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  36.88 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  44.35 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  29.38 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  29.85 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.83 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  40.3 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  33.54 
 
 		 180 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  39.6 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  38.67 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  35.98 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  43.55 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  34.94 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  35.33 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  34.2 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  37.33 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.41 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  35.38 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
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NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  33.95 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  33.95 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  35.36 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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