122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0958 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
651 aa  1334    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  36.39 
 
 
803 aa  193  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.22 
 
 
530 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.71 
 
 
748 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  31.22 
 
 
513 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  31.69 
 
 
513 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.55 
 
 
819 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.27 
 
 
606 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  31.9 
 
 
474 aa  93.2  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  31.94 
 
 
589 aa  91.7  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  30.51 
 
 
475 aa  91.3  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  34.72 
 
 
539 aa  83.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  34.21 
 
 
599 aa  83.2  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  26.1 
 
 
668 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  32.2 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 
683 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  24.03 
 
 
938 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  29.07 
 
 
810 aa  77.8  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  28.21 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.603764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  28.57 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.44 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  29.15 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  29.15 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  28.57 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.58 
 
 
732 aa  74.7  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.76 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  27.55 
 
 
781 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  29.26 
 
 
734 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  27.49 
 
 
403 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.52 
 
 
743 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  27.52 
 
 
743 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  28.8 
 
 
805 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.7 
 
 
421 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.51 
 
 
502 aa  67.4  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.31 
 
 
626 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  28.04 
 
 
655 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  31 
 
 
629 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.54 
 
 
754 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.8 
 
 
853 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 
729 aa  62.4  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  29.53 
 
 
653 aa  61.6  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  27.89 
 
 
899 aa  61.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.71 
 
 
822 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.56 
 
 
698 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.46 
 
 
568 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  30.49 
 
 
705 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.97 
 
 
590 aa  55.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  27.38 
 
 
352 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.24 
 
 
530 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  29.21 
 
 
587 aa  53.9  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  30.15 
 
 
900 aa  53.9  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  30.11 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.18 
 
 
765 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.64 
 
 
603 aa  52.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  39.6 
 
 
571 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  27.08 
 
 
4844 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  24.35 
 
 
741 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.31 
 
 
324 aa  51.6  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  35.29 
 
 
517 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  25.79 
 
 
303 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.41 
 
 
723 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.71 
 
 
398 aa  51.2  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  35.29 
 
 
517 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  36.05 
 
 
400 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.88 
 
 
510 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  31.46 
 
 
4979 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  33.72 
 
 
264 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.59 
 
 
449 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  27.18 
 
 
4917 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  33.03 
 
 
834 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  21.4 
 
 
620 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  23.64 
 
 
700 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  28.57 
 
 
498 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  32.56 
 
 
315 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  26.4 
 
 
666 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  32.56 
 
 
409 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.58 
 
 
310 aa  48.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.44 
 
 
585 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.49 
 
 
795 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  24.53 
 
 
678 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  30.84 
 
 
862 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  23.28 
 
 
313 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  25.29 
 
 
320 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.67 
 
 
346 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  35.64 
 
 
687 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1368  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.79 
 
 
301 aa  46.2  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000052679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.73 
 
 
662 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.63 
 
 
344 aa  46.6  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  25.79 
 
 
509 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.04 
 
 
481 aa  46.6  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  22.11 
 
 
638 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  30.08 
 
 
498 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  25.79 
 
 
509 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  23.92 
 
 
307 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  30.15 
 
 
845 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.92 
 
 
307 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  32.58 
 
 
297 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  32.95 
 
 
297 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2177  hypothetical protein  30.08 
 
 
457 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.344437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2215  hypothetical protein  30.08 
 
 
457 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>