254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0207 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  99.67 
 
 
307 aa  630  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  55.63 
 
 
313 aa  352  5e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  55.83 
 
 
324 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  54.51 
 
 
338 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  54.17 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  48.26 
 
 
322 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  47.73 
 
 
321 aa  281  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.21 
 
 
314 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  41.02 
 
 
306 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  34.6 
 
 
346 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  32.24 
 
 
317 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  30.07 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  34.12 
 
 
330 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.1 
 
 
373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  34.13 
 
 
315 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.86 
 
 
327 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  33.61 
 
 
409 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.94 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.89 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.21 
 
 
331 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.23 
 
 
327 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.08 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.17 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.89 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.34 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.29 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.18 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  30.89 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.52 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.57 
 
 
331 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  30.89 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.21 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.1 
 
 
326 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.89 
 
 
328 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.65 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  33.33 
 
 
400 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  30.77 
 
 
411 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.09 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  31.33 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  30.77 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.03 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.07 
 
 
322 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.72 
 
 
338 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.39 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.41 
 
 
330 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  30.77 
 
 
328 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.47 
 
 
332 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.93 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.97 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  30.41 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  28.98 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.9 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.02 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  29.17 
 
 
327 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.07 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  29.79 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  31.17 
 
 
263 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.47 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.56 
 
 
330 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.98 
 
 
329 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.21 
 
 
334 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.1 
 
 
343 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  31.33 
 
 
263 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  31.33 
 
 
263 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.67 
 
 
324 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.51 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.12 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.34 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  27.24 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  30.07 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  31.23 
 
 
324 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.08 
 
 
364 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.08 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.08 
 
 
345 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  30.71 
 
 
260 aa  92.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  27.91 
 
 
375 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.71 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  30.92 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  31.52 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  28.2 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  28.2 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  31.14 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  29.6 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  29.03 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  32.38 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.84 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  30.54 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  28.83 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.55 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  29.08 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.57 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.57 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  31.55 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  25.74 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  25.74 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  25.74 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.47 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  25.74 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  31.73 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>