201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7219 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  100 
 
 
400 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  65.53 
 
 
409 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  79.43 
 
 
315 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  36.33 
 
 
328 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  39.43 
 
 
330 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  36.33 
 
 
328 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  37.04 
 
 
343 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.92 
 
 
328 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.23 
 
 
331 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  36.99 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.25 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  37.3 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.66 
 
 
331 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  36.02 
 
 
322 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  35.25 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  36.99 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  34.78 
 
 
328 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  36.51 
 
 
327 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  36.1 
 
 
327 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  36.51 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.27 
 
 
327 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.85 
 
 
331 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.25 
 
 
331 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  36.21 
 
 
327 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.66 
 
 
332 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  34.66 
 
 
330 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.06 
 
 
329 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.25 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  33.21 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.71 
 
 
334 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.21 
 
 
329 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.84 
 
 
331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.85 
 
 
327 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.85 
 
 
327 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.12 
 
 
331 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.3 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.08 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.47 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  35.27 
 
 
345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  35.47 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.85 
 
 
364 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.85 
 
 
364 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  31.93 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.47 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  34.03 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.51 
 
 
328 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.94 
 
 
330 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.06 
 
 
343 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.2 
 
 
324 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  32.78 
 
 
327 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.2 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  36.93 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.93 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.78 
 
 
335 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  32.31 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.52 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  32.55 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  31.92 
 
 
338 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  32.79 
 
 
324 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  34.02 
 
 
306 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  31.98 
 
 
321 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 
308 aa  106  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.65 
 
 
4917 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  32.54 
 
 
322 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  30.33 
 
 
328 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  28.69 
 
 
4844 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  27.48 
 
 
4979 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.28 
 
 
314 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.99 
 
 
855 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  27.92 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  27.8 
 
 
1879 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  29.41 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  29.46 
 
 
266 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  30.45 
 
 
324 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.88 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  30.63 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  30.62 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  30.38 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  28.17 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  32.7 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  29.22 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  32.7 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  30.77 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  30.77 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.78 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  28.21 
 
 
264 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  27 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  28.21 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  29.91 
 
 
272 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  28.15 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  30.29 
 
 
285 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.1 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  29.1 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  30.47 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  30.63 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  31.28 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.18 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  28.69 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  30 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  30 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>