More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1812 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  98.23 
 
 		 509 aa  1019    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  100 
 
 		 509 aa  1036    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  66.26 
 
 		 489 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  38.89 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  39.84 
 
 		 466 aa  306  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.35 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  50.51 
 
 		 547 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  45.68 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  47.02 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  43.81 
 
 		 530 aa  240  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  46.34 
 
 		 498 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  42.28 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  47.57 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  47 
 
 		 512 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.23 
 
 		 375 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  47 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  47 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  46.18 
 
 		 498 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  46.18 
 
 		 498 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  48.39 
 
 		 523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  46.18 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.18 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  46.18 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  46.18 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  46.18 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  46.18 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  45.08 
 
 		 552 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  43.94 
 
 		 382 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  47.22 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  46.88 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  44.9 
 
 		 553 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  46.53 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  46.53 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  46.53 
 
 		 498 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  47.59 
 
 		 553 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  46.43 
 
 		 499 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.69 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  44.37 
 
 		 498 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  46.04 
 
 		 499 aa  226  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.07 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  40.47 
 
 		 543 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  46.62 
 
 		 468 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.23 
 
 		 526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.49 
 
 		 407 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  36.89 
 
 		 560 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.07 
 
 		 436 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.75 
 
 		 382 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.41 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  36.68 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  37 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.66 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  30.46 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  40.36 
 
 		 368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  39.11 
 
 		 368 aa  121  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  40.61 
 
 		 368 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  39.39 
 
 		 368 aa  120  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  27.48 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.12 
 
 		 343 aa  62  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  25.9 
 
 		 309 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  27.24 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.28 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  27.11 
 
 		 303 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.12 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  27.24 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  26.74 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.26 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  27.68 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.15 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.86 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.09 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  26.44 
 
 		 323 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.45 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  30.81 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  26.51 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  27.49 
 
 		 325 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  26.76 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  26.22 
 
 		 340 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.43 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0582  hypothetical protein  23.02 
 
 		 322 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  26.79 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  24.28 
 
 		 315 aa  55.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.49 
 
 		 332 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  25.58 
 
 		 303 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  27.88 
 
 		 310 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.35 
 
 		 318 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28 
 
 		 337 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  25.96 
 
 		 356 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.63 
 
 		 356 aa  54.7  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.59 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  23.81 
 
 		 327 aa  53.9  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.89 
 
 		 341 aa  54.3  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  26.16 
 
 		 457 aa  53.9  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.75 
 
 		 285 aa  53.9  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1750  ATPase  29.5 
 
 		 353 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.8 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  24.07 
 
 		 318 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  31.75 
 
 		 322 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.8 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  28.14 
 
 		 318 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.18 
 
 		 321 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>