45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0667 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  94.33 
 
 		 247 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  51.01 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  52.84 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  48.7 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  48.26 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  39.61 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  42.08 
 
 		 848 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  42.04 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  40 
 
 		 804 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  40 
 
 		 1121 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  40.45 
 
 		 1121 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 1121 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  35.61 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  35.8 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  35.83 
 
 		 1112 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  37.95 
 
 		 1143 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  36.02 
 
 		 1174 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  32.27 
 
 		 703 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.44 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  24.68 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  24.8 
 
 		 429 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  24.89 
 
 		 739 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1931 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  23.21 
 
 		 739 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  25.93 
 
 		 471 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  22.67 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  29.37 
 
 		 1066 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1633  hypothetical protein  25.15 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  24.57 
 
 		 4761 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.56 
 
 		 864 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  24.68 
 
 		 757 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  23.23 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.66 
 
 		 1064 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1367 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  26.23 
 
 		 741 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  25.33 
 
 		 1025 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  25.14 
 
 		 741 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  24.68 
 
 		 3507 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  25.14 
 
 		 741 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3234  hypothetical protein  30.34 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.02 
 
 		 1013 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29 
 
 		 1292 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  24.04 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  28.89 
 
 		 531 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>