More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2307 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 422 aa  879    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  45.37 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 425 aa  338  8e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 416 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 423 aa  323  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 437 aa  322  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 427 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 418 aa  319  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 433 aa  318  9e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 423 aa  318  9e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  41.65 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 436 aa  317  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 413 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  40.43 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 422 aa  306  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 413 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 421 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 420 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 427 aa  302  6.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 419 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 423 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 426 aa  302  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0424  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 423 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 426 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 423 aa  299  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 426 aa  298  9e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1278  seryl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 423 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.483732  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 423 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>